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Ép. 85 | Contrôle de filiation et passage à la puce SNP chez les équidés - Armelle Govignon

16 min 12 s

Parlons cheval - Le podcast de l'Institut français du cheval et de l'équitation Ép. 85 | Contrôle de filiation et passage à la puce SNP chez les équidés - Armelle Govignon Prêt à écouter
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Description de l’épisode

Obligatoire lors de la majorité des naissances, le contrôle de filiation repose sur la comparaison du génome du poulain et de ses parents. Un changement de technologie utilisée pour cette comparaison est attendu prochainement, avec l'utilisation de marqueurs génétiques SNP (Single Nucleotid Polymorphism) en remplacement des marqueurs microsatellites (MS) qui deviennent obsolètes. Obtenus après analyse en laboratoire de la prise de sang, grâce à la puce SNP ou puce ADN (à ne pas confondre avec la puce d'identification), les marqueurs SNP donnent des informations sur des milliers de points du génome du cheval.Dans ce podcast, Armelle Govignon, ingénieure de recherche à l'IFCE, présente le fonctionnement de la puce SNP développée pour l'ensemble des races françaises (puce "GENOFIL 1" de 60 0000 SNP) utilisée dans le cadre du projet Génomique Filière. Elle explique comment sera gérée la transition entre les deux technologies pour le contrôle de filiation grâce à la technique dite "d'imputation" validée par des travaux de recherche.Elle développe aussi toutes les valorisations possibles des données génomiques, les marqueurs SNP permettant de travailler sur de multiples objectifs : gènes d'intérêt connus (maladies, performances, robes), calcul d'indices génomiques, production de coefficient de consanguinité et d'indicateurs de variabilité génomiques, découverte de nouveaux gènes majeurs etc..Pour aller plus loin :• Webconférence - Génomique et sélection : les gènes d’intérêt• Vidéo - Session génétique JSIE• Fiches équipédia - Génétique• Webconférence -